واحد فناوری اطلاعات پژوهشکده باقرالعلوم علیه السلام درزمینهٔ نگهداری و پشتیبانی از سامانه‌های سخت‌افزاری، نرم‌افزاری و شبکه و تولید نرم‌افزارهای وب و موبایل فعالیت می‌کند. از اساسی‌ترین پایه‌ها در توسعه و به نتیجه رسیدن طرح‌های فناوری اطلاعات؛ آموزش، اطلاع‌رسانی و فرهنگ‌سازی در این زمینه است. این راستا این واحد علاوه بر انجام مأموریت گفته شده وظیفه‌ خدمات‌دهی به گروه‌های پژوهشی  را نیز به عهده دارد.